Panel 52 gene relevante in tumori solide Oncomine Focus Assay ADN + ARN

Test biomarker comprehensiv pentru tumorile solide

Ce sunt genele relevante în tumori solide?

Procesul evolutiv al tumorilor solide este condus, în principal, de modificări somatice la nivelul unor gene cu rol important în oncogeneză, cunoscute sub denumirea generică de gene driver (gene relevante).

Identificarea acestor gene, respectiv a mutațiilor somatice la nivelul lor (mutații driver), joacă un rol crucial în diagnosticarea și tratamentul personalizat (terapia țintită) al afecțiunilor maligne.

Mutațiile driver:

• Se produc la nivelul proto-oncogenelor și al genelor supresoare tumorale;

• Sunt implicate în dezvoltarea/progresia tumorală;

• Conferă avantaj selectiv de creștere celulei tumorale;

• Conferă potențial metastatic;

• Conferă rezistență chimioterapeutică;

• Prezintă importanță în:

  • stabilirea diagnosticului;

  • selectarea terapiei țintite – prognostic;

  • răspuns terapeutic (medicamente oncologice aprobate FDA - Food and Drug Administration / EMA - European Medicines Agency).

• Aplicată inițial pentru afecțiunile infecțioase;

• Concepută pentru a inhiba o anumită proteină cu funcție anormală,

• Reprezintă un pilon cheie al terapiei personalizate în cancer;

• Anii 2000 - introducerea terapiei țintite și în oncologie - Right drug – Right dose – Right person versus One size fits all;

• Utilizează inhibitori kinazici - au proprietatea de a “ținti” gene sau proteine specifice, necesare pentru creșterea, supraviețuirea și migrarea celulelor tumorale:

  • de tipul - small molecule kinase inhibitors

  • larger molecules (anticorpi monoclonali, peptide)

  • > 37 aprobați FDA până în prezent

Protein-kinazele:

• Genomul uman codifică peste 500 de astfel de proteine;

• Rol esențial în creșterea, proliferarea și diferențierea celulară;

• Mutații la nivelul genelor codificatoare - disfuncția protein-kinazelor - asociate cu dezvoltarea cancerului și progresia tumorală;

• Privite ca ținte importante pentru dezvoltarea de terapii moleculare țintite, reprezentând al doilea cel mai vizat grup țintă pentru medicamentele anti-tumorale;

• 3 categorii:

  • tirozin kinaze

  • serin/threonin kinaze

  • enzime tirozin kinaze-like

Care este utilitatea acestui Panel?

Avantajele testării:

• Analiza concomitentă ADN și ARN extras din aceeași probă de țesut inclus în parafină (FFPE);
• Cantitate redusă de material genetic (2-3 secțiuni de țesut inclus în parafină), ceea ce permite chiar și analiza probelor cu material tisular redus (biopsii obținute prin FNA - fine-needle aspiration);
• Testare comprehensivă - elimină utilizarea de tehnologii multiple, în cascadă (FISH, IHC, PCR, Real-Time PCR);
• Evaluare simultană a unui număr mare de biomarkeri - multiple opțiuni de tratament, altele decât terapia standard de îngrijire.

• Analiza a peste 1000 de variante patologice la nivelul a 52 de gene driver, cum ar fi EGFR, BRAF, KRAS, ERBB2 și MET, precum și fuziuni care implică genele ALK, ROS1, RET, NTRK1/2/3 etc.

• Detecția simultană de:

  • Mutații hotspot (SNV, InDel) la nivelul a 35 de gene:
    AKT1, ALK, AR, BRAF, CDK4, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, FGFR2, FGFR3, GNA11, GNAQ, HRAS, IDH1, IDH2, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MTOR, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, RET, ROS1, SMO

  • CNV la nivelul a 19 gene:
    ALK, AR, BRAF, CCND1, CDK4, CDK6, EGFR, ERBB2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, KIT, KRAS, MET, MYC, MYCN, PDGFRA, PIK3CA

  • Fuziuni genice – implică 23 de gene:
    ABL1, AKT3, ALK, AXL, BRAF, EGFR, ERBB2, ERG, ETV1, ETV4, ETV5, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PPARG, RAF1, RET, ROS1

• Fiecare dintre aceste variante reprezintă ținte terapeutice pentru diferite medicamente oncologice aprobate FDA.

• Conform National Cancer Institute (martie 2025), pentru 31 de tipuri de cancer – inclusiv cele 18 testate prin acest panel – a fost aprobat un număr cuprins între 4 și 39 de medicamente (inhibitori de tirozin kinază sau anticorpi monoclonali), în funcție de tipul de cancer.
  
  De exemplu:

  • Prostată și piele (melanom și carcinom bazocelular): câte 20 de medicamente

  • Pancreas: 7

  • Tiroidă: 8

  • Tumori solide cu diverse localizări: 9

• Identificarea opțiunilor de tratament compatibile cu profilul tumoral molecular, cu eligibilitate pentru tratament personalizat în multiple tipuri de cancer, cât și identificarea de noi ținte terapeutice;

• Obținerea de indicații timpurii despre rezistența la tratament, eliminându-se astfel toxicitatea unui tratament fără beneficiu terapeutic la care ar fi expuși non-responderii;

• Eliberarea unui rezultat care conține și un raport Oncomine, ce are acces la baza de date ClinVar, în care sunt prezentate informații despre:

  • variantele cu semnificație clinică detectate;

  • potențialul impact terapeutic (sau absența acestuia);

  • numărul terapiilor țintite eligibile;

  • numărul trialurilor clinice disponibile la momentul actual.

• Utilizarea unui panel targeted-NGS nu creează probleme specifice pentru interpretarea patogenității variantelor identificate și, prin urmare, pentru evaluarea riscului – așa cum se întâmplă în cazul panelurilor NGS mari (>400 gene);

• Tehnica prezintă specificitate și sensibilitate superioară tehnicilor clasice (IHC, Real-Time PCR, FISH);

1. Consult oncologic pentru orientarea testării genetice.

2. Solicitarea probei de țesut în parafină (bloc FFPE) de la unitatea medicală unde a fost stabilit diagnosticul de cancer.

3 .Analiză de laborator. Testul se realizează pe secțiuni de țesut inclus în parafină (FFPE), în general cu grosimea de 5 microni, și etalate pe lamă microscopică, fără a fi colorate prin colorația clasică cu hematoxilin-eozină.

Medicul anatomo-patolog indică o zonă cu celularitate tumorală crescută, cu zone de necroză, fibroză sau infiltrat inflamator absente sau în cantități cât mai reduse, de unde se va efectua simultan extracția de ADN și ARN.

Testarea genetică pentru detecția mutațiilor la nivelul celor 52 de gene relevante se realizează prin metoda NGS.

4. Consiliere oncologică pentru stabilirea conduitei terapeutice și a managementului oncologic.

5. Consult/sfat genetic pentru membrii familiei, în cazul unui rezultat pozitiv.

• Pacienților oncologici, de ambele sexe, diagnosticați cu diferite tipuri de tumori solide, în stadiu local avansat sau metastazat, pentru care există aprobată FDA/EMA o terapie țintită, conform ghidurilor în vigoare (NCCN, ESMO, ASCO).

• Pacienților oncologici cu rezultat negativ pentru o testare țintită (ex. Melanom BRAF negativ), în vederea extinderii analizei genetice pentru identificarea subtipului molecular și a personalizării terapiei pacientului oncologic.

• La momentul diagnosticului;

• În caz de rezistență la prima linie de tratament.