Evaluare risc preeclampsie (sFlt-1/PlGF) (>20 saptamani)

Analiza exomului (partea codificatoare a genomului) Testul acopera analiza genelor nucleare (>20000 gene) si intregul genom mitocondrial (37 gene)

WES este acronimul de la Whole Exome Sequencing, ceea ce în traducere înseamnă secvențierea întregului exom, din constituența celor peste 20 000 de gene.

Exomul este partea activă (codanta) din interiorul unei gene. 

Aceasta analiza evalueaza întregul exom, în special fragmentele codante/active ale tuturor genelor și regiunile cunoscute a fi asociate cu boli genetice, localizate în imediata vecinătate a exonilor sau în regiunile reglatoare.

O astfel de analiză este indicată în situațiile în care alte analize genetice nu au identificat cauza bolii și semnele clinice ridică suspiciunea unei boli genetice.

În urma unul WES se raportează doar genele cunoscute a fi asoiate cu boală, respectiv variantele genice de clasa 5 și clasa 4.
Rareori, dacă semnele clinice oferite laboratorului nu reusesc să identifice o variantă genică patogenă se raportează și VUS-urile

VUS - este acronimul de la Variant of Uncertain Significance.

Acest termen se referă la variantele genice a caror semnificație clinică este la momentul de față necunoscută.

Variantele genice identificate la o testare prin secvențiere de ultimă generație (NGS), sunt clasificate în felul următor:

Clasa 1 - variante genice patogene (care sunt cu siguranța cauzatoare de boală)
Clasa 2 - variante genice probabil patogene (care cel mai probabil sunt cauzatoare de boală)
Clasa 3 - variante cu semnificație clinica incertă (VUS-uri), acestea sunt situațiile în care nu se cunoaște implicarea variantei genice identificate în etiologia bolii, iar studiile până la momentul de față sunt contradictorii.
Clasa 4 - variante probabil benigne (care cel mai probabil nu sunt asociate cu boala)
Clasa 5 - variante benigne (care sigur nu sunt asociate cu boala).

Genetica este în momentul de față o știință în continuă evoluție, iar descoperile se produc continuu, ceea ce face ca actuala clasificare a variantelor genice să fie relativ instabilă, mai ales pentru variantele de clasa 3 - VUS-uri. Odată ce apar dovezi clinice (cazuri documentate), dovezi paraclinice (analize de laborator complementare), dovezi experimentale în vivo (rezultatele studiilor pe animale sunt validate), variantele pot fi oricand reclasificate.

Pentru interpretarea corectă a unui WES sunt necesare cât mai multe detalii clinice, anamnestice în cadrul cărora se realizeaza și arborele genealogic. Din interpretarea unui WES se pot extrage informații referitoare la statutul de purtător (doar pentru genele cunoscute a fi frecvent implicate în boli cu transmitere recesivă, acestea fiind selectate conform ghidurilor), referitoare la statutul de predispoziție pentru cancer (doar dacă în acea familie investigată sunt semne care să sugereze o implicare importantă a factorilor genetici în oncogeneza). 

Această abordare particulara este esențială în interpretarea WES si WGS pentru a reuși oferirea unui rezultat țintit, util din punct de vedere clinic pentru patologia cercetată, în caz contrar există riscul să se depășească timpul de interpretare sau să se omite anumite informații.
În cazuri speciale se pot solicita datele RAW, nefiltrate, neanalizate, obținute în urma secvențierii, dar dimensiunea acestora și interpretarea este deosebit de dificilă.

• Tehnica complexă ce permite analiza exomului (partea codificatoare a ADN-ului)
• Testul acoperă analiza genelor nucleare (>20000 gene) și întregul genom mitocondrial (37 gene)
• Sunt cuprinse în analiză regiunile codificante ale genelor nucleare +/- 10pb la granița intron-exon și analiza completă a genomului mitocondrial
• Testul analizează și variații ale copiilor de gene CNV

Se recomandă atunci când:

• ofenotip complex, heterogen și nespecific
• otestări genetice anterioare țintite negative (care nu au elucidat cauza genetică care să explice fenotipul)
• osuspiciune boală mitocondrială