Analiza ADN mitocondrial - secventiere NGS a genomului mitocondrial - CentoMito Genome

Analiza este utilizată în evaluarea bolilor genetice rare și a afecțiunilor neurodegenerative, fiind indicată în special în cazurile cu suspiciune de boli mitocondriale multisistemice.

Descriere generală

Termen de execuție*

45 zile lucrătoare (în funcție de configurația testului și complexitatea cazului)

Despre CentoMito Genome – secvențiere mtDNA (NGS)

CentoMito Genome este o analiză care investighează întregul genom mitocondrial (~16,6 kb), responsabil de funcționarea lanțului respirator și producția de energie celulară (ATP).

Testul utilizează tehnologie NGS cu acoperire ridicată și permite evaluarea completă a variantelor mitocondriale, incluzând:

• mutații punctiforme (SNV)
• deleții și inserții mitocondriale
• variante heteroplasmice (proporția ADN-ului mutant față de ADN-ul normal)
• variante homoplasmice
• regiuni codante ale genelor mitocondriale implicate în complexele respiratorii I–V

CentoMito Genome face parte dintr-un portofoliu de soluții pentru diagnostic genomic extins, fiind integrat într-o platformă de analiză genomică drept test specializat pentru evaluarea genomului mitocondrial, cu interpretare clinică bazată pe date fenotipice și pe baze de date dedicate bolilor rare și afecțiunilor genetice.

Afecțiuni sau simptome asociate

Testul este indicat în evaluarea cauzelor genetice pentru:

• boli mitocondriale primare
• encefalopatii mitocondriale
• miopatii mitocondriale
• neuropatii periferice de cauză genetică
• epilepsii farmacorezistente
• atrofie optică ereditară
• sindroame neurodegenerative precoce
• acidoză lactică persistentă
• fatigabilitate severă de cauză necunoscută
• afectare multisistemică (neurologică, musculară, cardiacă și metabolică)
• suspiciune de transmitere maternă a unei boli genetice
• cazuri nediagnosticate prin WES/WGS sau paneluri genetice

Cui se adresează

• pacienților cu suspiciune clinică de boală mitocondrială
• copiilor cu întârziere de dezvoltare și afectare neuromusculară
• adulților cu simptome multisistemice inexplicabile
• pacienților cu epilepsii sau neuropatii fără etiologie clară
• cazurilor cu istoric familial sugestiv de transmitere maternă
• pacienților cu rezultate negative la investigațiile genetice bazate pe ADN nuclear (WES/WGS)

Metodologie de testare

• extracție AND-ului din sânge periferic recoltat pe EDTA
• amplificarea și secvențierea completă a genomului mitocondrial
• tehnologie NGS cu acoperire ridicată a mtDNA
• analiză a celor 37 de gene mitocondriale
• detectarea variantelor SNV și INDEL
• cuantificarea heteroplasmiei (proporția ADN-ului mitocondrial mutant față de ADN-ul mitocondrial normal)
• analiză bioinformatică avansată și interpretare clinică
• corelare fenotip–genotip pentru clasificarea variantelor

Beneficii și importanță clinică

• analiză completă a genomului mitocondrial într-un singur test
• detectează mutații rare și heteroplasmii cu impact clinic
• ajută la confirmarea diagnosticului de boală mitocondrială
• permite diferențierea între cauzele mitocondriale și non-mitocondriale
• sprijină diagnosticul în cazuri multisistemice complexe
• contribuie la consilierea genetică familială pe linie maternă
• poate ghida managementul metabolic și terapeutic al pacientului

Particularități și limitări

• analizează exclusiv ADN-ul mitocondrial (nu și AND-ul nuclear)
• unele deleții mari sau rearanjamente complexe pot necesita metode complementare
• interpretarea depinde de gradul de heteroplasmie și contextul clinic
• pot exista variante cu semnificație incertă (VUS)
• nu detectează cauze non-mitocondriale ale simptomelor similare
• necesită corelare clinică și metabolică pentru interpretare completă

Tip probă și condiții de recoltare

Probă necesară:

• sânge integral EDTA (2 x 6 ml)

Condiții de recoltare:

• recoltare prin puncție venoasă în vacutainere cu EDTA
• transport în condiții controlate conform protocolului laboratorului
• recomandată completarea datelor clinice detaliate
• nu necesită pregătire specială a pacientului

Analize asociate recomandate

• WES (Whole Exome Sequencing) – pentru excluderea cauzelor nucleare
• WGS (Whole Genome Sequencing) – evaluare genomică completă
• Panel NGS boli neuromusculare – pentru fenotipuri specifice
• Lactat, piruvat, CPK – evaluare metabolică funcțională
• Biopsie musculară – în cazuri selectate pentru confirmare histologică
• RMN cerebral și muscular – evaluarea afectării structurale