Analiza genei CFTR prin secvențiere NGS este un test genetic avansat utilizat pentru identificarea variantelor patogene asociate cu fibroza chistică (mucoviscidoza) și statusul de purtător. Testul permite analiza completă a regiunilor codante și a zonelor splice ale genei CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator), responsabilă de reglarea transportului de clor și sodiu la nivel epitelial.
*Termenul de execuție reprezintă numărul maxim de zile lucrătoare în care va fi eliberat rezultatul. Acest termen are rol informativ și va fi confirmat în punctul de recoltare.
Fibroza chistică este o boală genetică autosomal recesivă, multisistemică, caracterizată prin secreții vâscoase la nivel pulmonar, pancreatic și digestiv, cu evoluție progresivă și impact major asupra funcției respiratorii și nutriționale.
Termen de execuție*
45 zile lucrătoare
Despre analiza genei CFTR – fibroza chistică
Gena CFTR, localizată pe cromozomul 7q31.2, codifică un canal ionic responsabil de transportul clorului la nivelul epiteliilor respirator, digestiv, pancreatic și sudoral. Disfuncția acestui canal determină deshidratarea secrețiilor și formarea mucusului vâscos caracteristic bolii.
Cea mai frecventă mutație asociată este p.Phe508del (F508del), însă există peste 2.000 de variante descrise ale genei CFTR, cu impact variabil asupra funcției proteinei.
Secvențierea NGS permite identificarea:
mutațiilor punctiforme (SNV)
inserțiilor și delețiilor mici (INDEL)
variantelor splice-site
variantelor patogene rare sau private
variantelor cu semnificație incertă (VUS)
Afecțiuni sau simptome asociate
Testul este indicat în evaluarea:
fibrozei chistice (mucoviscidoza)
infecțiilor respiratorii recurente
bronșiectaziilor difuze
tusei cronice productive
insuficienței pancreatice exocrine
malabsorbției și malnutriției
ileusului meconial la nou-născuți
infertilității masculine (azoospermie obstructivă prin absența canalelor deferente)
pancreatitei cronice idiopatice
suspiciunii de boală CFTR-related disorder
Cui se adresează
pacienților cu suspiciune clinică de fibroză chistică
nou-născuților cu screening neonatal pozitiv
copiilor cu infecții respiratorii recurente și stagnare ponderală
pacienților cu bronșiectazii fără cauză clară
bărbaților cu infertilitate de cauză obstructivă
cuplurilor aflate în evaluare preconcepțională
rudelor de gradul I ale pacienților diagnosticați
cazurilor cu fenotip atipic CFTR-related
Metodologie de testare
extracție ADN genomic din sânge periferic EDTA
secvențiere de nouă generație (NGS) a genei CFTR
analiză bioinformatică a regiunilor codante și splice
identificarea:
SNV (mutații punctiforme)
INDEL (inserții/deleții mici)
variante patogene și probabil patogene
clasificare conform ghidurilor ACMG
interpretare în corelație cu baza de date Centogene pentru boli rare și cu fenotipul CFTR
Beneficii și importanță clinică
confirmă diagnosticul molecular al fibrozei chistice
permite identificarea purtătorilor sănătoși
contribuie la evaluarea riscului reproductiv în cupluri
ajută la diagnosticarea formelor atipice sau CFTR-related disorders
permite consiliere genetică familială corectă
sprijină deciziile terapeutice și de monitorizare
facilitează accesul la terapii modulatorii CFTR
Particularități și limitări
gena CFTR prezintă o mare heterogenitate mutațională (>2000 de variante descrise)
unele deleții/duplicații mari pot necesita testare complementară (MLPA)
pot fi identificate variante cu semnificație incertă (VUS)
un rezultat negativ nu exclude complet diagnosticul în forme rare sau mutații nedetectate prin metoda utilizată
interpretarea trebuie corelată cu testul funcțional (testul sudorii) și tabloul clinic
variabilitatea fenotipică poate fi mare chiar între și pacienți cu aceleași mutații
Tip probă și condiții de recoltare
Probă necesară:
sânge integral EDTA
Volum recomandat:
2 × 6 ml sânge periferic
Condiții de recoltare:
recoltare venoasă standard în vacutainer EDTA
nu necesită pregătire specială
transport conform protocolului laboratorului
recomandată completarea datelor clinice și istoricului familial
Analize asociate recomandate
Testul sudorii (clor în transpirație) – diagnostic funcțional standard
Analiza delețiilor/duplicațiilor CFTR (MLPA)
Panel NGS boli respiratorii genetice
Elastază pancreatică fecală
Cultură secreții bronșice
Testare genetică familială CFTR
Screening preconcepțional pentru cupluri
Particularitate clinică importantă
Fibroza chistică este una dintre cele mai frecvente boli genetice severe la populația caucaziană. Diagnosticul molecular complet al genei CFTR este esențial nu doar pentru confirmarea bolii, ci și pentru identificarea pacienților eligibili pentru terapii modulatoare CFTR (corectoare și potentiatoare), care pot modifica semnificativ evoluția bolii și calitatea vieții.