PAN-CANCER COMPREHENSIVE este un test de profilare moleculară somatică a tumorilor solide, bazat pe tehnologia NGS, conceput pentru identificarea unui spectru larg de alterări genetice relevante clinic. Testul combină analiza mutațiilor hotspot, secvențierea genelor complete, identificarea modificărilor numărului de copii (CNV) și detectarea fuziunilor genice inter- și intragenice.
Prin analiza simultană a mai multor căi moleculare implicate în oncogeneză, testul contribuie la caracterizarea genomică a tumorii și la identificarea biomarkerilor care pot fi relevanți pentru medicina oncologică de precizie, selecția terapiilor țintite și includerea în studii clinice.
*Termenul de execuție reprezintă numărul maxim de zile lucrătoare în care va fi eliberat rezultatul. Acest termen are rol informativ și va fi confirmat în punctul de recoltare.
Cancerul este o boală genomică heterogenă, în care acumularea de modificări genetice poate determina activarea oncogenelor, inactivarea genelor supresoare tumorale și alterarea mecanismelor de reparare a ADN-ului.
PAN-CANCER COMPREHENSIVE investighează simultan mai multe clase de alterări moleculare și mai multe căi implicate în oncogeneză:
calea MAPK/RAS/RAF,
calea PI3K/AKT/mTOR,
receptori tirozin-kinazici,
controlul ciclului celular,
gene supresoare tumorale,
mecanisme de reparare a ADN-ului,
căi implicate în instabilitatea genomică,
mecanisme de proliferare și diferențiere celulară,
fuziuni oncogenice și rearanjări genomice,
amplificări și deleții genice.
Gene analizate
Testul utilizează o abordare multicomponentă:
1. Hotspot genes – analiză focalizată a regiunilor hotspot pentru identificarea variantelor recurente oncogenice:
fuziuni/rearanjări intragenice, în funcție de designul assay-ului.
Această combinație permite o caracterizare moleculară mai largă decât analiza exclusivă a mutațiilor hotspot.
Cui se adresează
pacienților cu tumori solide confirmate histopatologic,
pacienților cu boală avansată sau metastatică,
cazurilor în care este necesară caracterizarea moleculară a tumorii,
pacienților pentru care se ia în considerare terapia țintită,
cazurilor cu progresie sau rezistență la tratament, atunci când profilarea moleculară este indicată,
tumorilor cu profil molecular neclar după testări țintite anterioare,
pacienților evaluați în cadrul programelor de medicină oncologică de precizie,
cazurilor în care se urmărește identificarea unor biomarkeri pentru studii clinice.
Metodologie de testare
secvențiere NGS (Next Generation Sequencing),
analiză moleculară a ADN-ului tumoral și, pentru componenta de fuziuni, a ARN-ului atunci când este prevăzut de metodologia assay-ului,
analiză hotspot,
secvențiere full-length pentru genele incluse în această categorie,
analiză a variațiilor numărului de copii (CNV),
analiză a fuziunilor genice inter- și intragenice,
analiză bioinformatică avansată,
interpretarea variantelor în context oncologic.
Beneficii și importanță clinică
oferă o caracterizare moleculară extinsă a tumorii,
identifică alterări genetice potențial relevante pentru tratamentul țintit,
permite investigarea simultană a mai multor mecanisme moleculare,
poate identifica alterări care nu sunt evidențiate prin testarea unei singure gene,
contribuie la selecția biomarkerilor relevanți pentru medicina de precizie,
poate susține alegerea unor terapii țintite atunci când alterarea identificată are relevanță clinică,
poate contribui la identificarea pacienților eligibili pentru anumite studii clinice,
permite o utilizare mai eficientă a materialului tumoral disponibil.
Particularități și limitări
rezultatul este destinat caracterizării somatice a tumorii și trebuie interpretat în context clinic, histopatologic și oncologic,
identificarea unei variante nu înseamnă automat că aceasta este responsabilă de dezvoltarea tumorii sau că există o terapie aprobată pentru respectiva alterare,
relevanța clinică a unei variante poate depinde de tipul și localizarea tumorii,
pot fi identificate variante cu semnificație clinică incertă (VUS),
un rezultat negativ nu exclude existența unor alterări genomice care nu sunt acoperite de assay,
calitatea și cantitatea materialului tumoral pot influența performanța analizei,
heterogenitatea tumorală și procentul de celule tumorale pot influența detectarea variantelor,
anumite alterări structurale complexe pot necesita metode complementare,
rezultatele trebuie interpretate împreună cu datele histopatologice, imunohistochimice și clinice.
Tip de probă
țesut tumoral FFPE (bloc de parafină),
pentru analiza fuziunilor, poate fi necesar material adecvat pentru extracția ARN-ului.
Recoltare și condiții
se utilizează material tumoral fixat în formalină și inclus în parafină (FFPE);
este recomandată evaluarea prealabilă a materialului de către anatomopatolog;
proba trebuie să conțină o proporție tumorală adecvată pentru analiza moleculară;
blocul sau secțiunile trebuie să fie însoțite de documentele patologice relevante;
pentru analiza ARN și a fuziunilor, integritatea materialului poate fi determinantă;