Testare MLPA – gena OTC (Deficienta de ornitin-transcarbamilaza)
Analiză genetică moleculară prin tehnica MLPA, utilizată pentru detectarea delețiilor și duplicațiilor la nivelul genei OTC, asociate cu deficiența de ornitin-transcarbamilază (OTC deficiency). Testul completează investigația genetică atunci când secvențierea NGS/Sanger nu identifică variante patogene sau când există suspiciunea unor rearanjamente genomice de dimensiuni mai mari.
*Termenul de execuție reprezintă numărul maxim de zile lucrătoare în care va fi eliberat rezultatul. Acest termen are rol informativ și va fi confirmat în punctul de recoltare.
Deficiența de ornitin-transcarbamilază (OTC) este cea mai frecventă tulburare ereditară a ciclului ureei și este cauzată de modificări ale genei OTC, localizată pe cromozomul X (Xp21.1).
Deși majoritatea cazurilor sunt determinate de mutații punctiforme detectabile prin secvențiere, un procent semnificativ de pacienți prezintă:
deleții exonice,
duplicații exonice,
deleții parțiale ale genei,
rearanjamente structurale care nu pot fi identificate prin secvențiere convențională.
Analiza MLPA este special concepută pentru detectarea modificărilor de număr de copii (CNV – Copy Number Variants) la nivelul genei OTC.
Deficitul OTC determină afectarea ciclului ureei și acumularea toxică de amoniac în organism, manifestările putând varia de la forme neonatale severe până la forme cu debut tardiv.
Indicații de testare
Suspiciune clinică de deficiență de ornitin-transcarbamilază
Hiperamoniemie inexplicabilă
Rezultat negativ sau neconcludent la secvențierea genei OTC
Confirmarea unei deleții/duplicații suspectate
Screening familial după identificarea unei anomalii structurale OTC
Evaluarea purtătoarelor în familii cu diagnostic confirmat
Consiliere genetică reproductivă
Cui se adresează
Nou-născuților cu hiperamoniemie severă
Copiilor și adulților cu tulburări ale ciclului ureei
Femeilor cu risc de a fi purtătoare ale unei mutații OTC
Familiilor cu diagnostic genetic confirmat de deficiență OTC
Medicilor geneticieni, pediatri, neurologi și specialiștilor în boli metabolice
Metodologie de testare
Extracție ADN genomic din sânge periferic
Analiză prin tehnologia MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification)
Evaluarea tuturor exonilor genei OTC
Detectarea:
delețiilor heterozigote sau hemizigote
duplicațiilor exonice
delețiilor complete sau parțiale ale genei
variațiilor de număr de copii (CNV)
Interpretare conform ghidurilor ACMG și standardelor internaționale de genetică moleculară
Beneficii și importanță clinică
Detectează modificări genetice care nu pot fi identificate prin NGS sau secvențiere Sanger
Completează evaluarea moleculară a genei OTC
Poate crește rata de diagnostic al deficienței OTC
Permite identificarea purtătorilor din familie
Contribuie la managementul precoce al bolii
Facilitează consilierea genetică și planificarea familială
Ajută la stabilirea unui diagnostic molecular complet
Analize asociate recomandate
Investigații genetice
Secvențiere NGS a genei OTC
Testare țintită familială pentru mutația identificată
Panel NGS pentru tulburările ciclului ureei
Exom clinic (WES) în cazurile complexe
Investigații metabolice
Amoniac plasmatic
Aminoacizi plasmatici
Acid orotic urinar
Acizi organici urinari
Profil metabolic extins
Evaluare clinică
Consult genetic
Consult de boli metabolice
Evaluare neurologică
Monitorizarea funcției hepatice
Probă recoltată / condiții analiză
Sânge total EDTA – 2 x 6 ml
Nu necesită condiții speciale de recoltare
Documente necesare
Recomandare medicală
Istoric clinic și metabolic
Rezultate genetice anterioare (dacă există)
Raport NGS/Sanger anterior (dacă testarea este complementară)
Denumiri alternative
OTC MLPA analysis
OTC deletion/duplication testing
Ornithine transcarbamylase MLPA
OTC copy number analysis
OTC CNV analysis
OTC gene dosage analysis
OTC rearrangement testing
Urea cycle disorder MLPA panel
OTC exon deletion/duplication test
OTC gene MLPA assay
Particularități ale testului
Testarea MLPA a genei OTC este destinată identificării delețiilor și duplicațiilor exonice sau genice, modificări care nu sunt detectate în mod optim prin secvențiere standard. Analiza este recomandată în special la pacienții cu suspiciune clinică puternică de deficiență OTC și rezultat negativ la secvențierea genei. Pentru o evaluare genetică completă, se recomandă asocierea cu secvențierea NGS a genei OTC, cele două metode fiind complementare.